中国青少年足球联赛设立竞赛办公室，设在中国足协，办公室主任由中国足协主席担任，办公室成员由教育部、体育总局、中国足协选派，负责制定和解释竞赛方案、组织竞赛工作、制定规章制度、选拔优秀球员等工作。
中国青少年足球联赛定位为我国覆盖面最广、参与人数最多、竞技水平最高、社会影响力最大的顶级青少年足球赛事，在赛程编制、人员参与、赛事转播等方面均给予优先考虑，主要由地方预选赛和全国总决赛两大赛区组成。
中国青少年足球联赛面向全民青少年，打破参与壁垒，兼顾普及与提高。分为小学、初中、高中、大学四个年龄段，根据不同年龄段的特点，安排符合青少年身心发展和足球人才培养规律的赛制。体校队、校队、俱乐部青训队、社会青训机构等队伍均可自由参赛，不受任何限制。通过联赛，对发掘和选拔出的优秀青少年足球人才进行提高训练，为各年龄段国家队输送优秀人才。
为满足不同青少年球队更多比赛需求，可适当保留观看性强、人气高的品牌赛事，如全国青少年校园足球联赛暨夏令营、全国体校杯足球锦标赛、中国足协青少年足球锦标赛等。同时，整合、取消中国中学生足球协会杯、中国高中足球锦标赛、中国大学生足球协会杯、中国大学生足球联赛、中国足协青超联赛、中国足协青少年社会品牌赛事，不断创新方式推进融合。
中国青少年足球联赛的竞赛设计遵循四项基本原则：
1.把青少年球员健康成长作为总目标，保障青少年球员文化学习，坚持文化教育与专业训练相平衡，培养德智体美劳全面发展的社会主义建设者和接班人。
二是摒弃冠军主义，全民开放，普及与提高相结合，打破参与壁垒，充分扩大参与足球运动的青少年数量，为中国足球发展奠定坚实基础。
3.因地制宜安排比赛时间和地点，推动地方青少年赛事发展，逐步建立稳定、长效、多层次的地方青少年赛事体系。地方赛事与全国赛事应有序协调，互不影响、互不冲突。
四是处理好训练与比赛的关系，按照《中国足协青少年训练大纲》要求，不断提高训练和比赛质量，有效发挥比赛效应。通过比赛选拔优秀人才，建立青少年球员数据库，为各级国家队组建打下坚实基础。
中国青少年足球联赛赛事架构按参赛年龄段分为四个部分，男女组共18个组别，分别为小学年龄段U8—U12男女各10组；初中年龄段男子U13、U15组，高中年龄段男子U17组；女子初中、高中年龄段U13、U15、U17组；男子大学年龄段U19组，女子大学年龄段。
全国总决赛是中国青少年足球联赛最高级别赛事，参赛队伍通过地方预选赛选拔。全国总决赛由赛事办公室组织，地方预选赛由地方组织组织。地方预选赛因地制宜组织开展，参赛队伍总数和名额分配由地方组织根据当地实际情况确定。符合全覆盖、不设门槛原则的现有赛事可直接作为预选赛，无需单独举办。
中国青少年足球联赛还确定了奖励机制，按照不低于其他青少年足球赛事的标准，建立包括荣誉奖励、奖金激励、资格考核、选拔入库等在内的奖励机制体系，设立球队名次奖、球员个人奖等，并相应颁发奖杯、奖牌。一次性奖金发放研究，范围、金额等具体标准由竞赛办公室确定。允许一定比例的优秀球员参与运动员技术等级评定，由教育、体育部门按照《运动员技术等级标准》制定统一标准，共同评定。建立优秀球员档案，为各级国家队选拔提供人才支撑。要发挥奖励机制引领作用，坚持公平公正公开，防止暗箱操作，确保奖励结果经得起各方检验，动员更多青少年积极参与，增强赛事吸引力。