1966年世界杯葡萄牙队阵容
但随后葡萄牙足球陷入低迷，直到二十年后才重返世界杯。 然而1986年墨西哥世界杯，葡萄牙再次小组赛失利，以1胜2负小组垫底被淘汰。 三届世界杯之后，葡萄牙再次无缘世界杯。
直到2002年日韩世界杯，葡萄牙在欧洲预选赛中遭遇死亡之组，与上届世界杯冠军荷兰和北爱尔兰分在一组。 然而葡萄牙却奇迹般地从死亡之组中脱颖而出，以7胜3平保持不败。 小组第一名将直接晋级。 小组赛，葡萄牙首轮2-3不敌美国，次轮4-0击败波兰，决赛对阵东道主韩国。 葡萄牙要想出线就必须获胜。 然而，面对不公平且颇具争议的判罚，球队0-1不敌韩国队，以小组第三的身份被淘汰。
从2002年开始，葡萄牙终于开始了稳定进军世界杯的阶段。 2006年德国世界杯，葡萄牙迎来了他们的新王。 C罗进入葡萄牙国家队，葡萄牙没有缺席四届世界杯。 2006年德国世界杯，葡萄牙在小组赛中击败了墨西哥、安哥拉和伊朗，以全胜晋级淘汰赛，随后又淘汰了荷兰和英格兰，可惜半程输给了齐达内领衔的法国。 - 决赛，最终夺得世界杯冠军。